Setiap hewan,tumbuhan dan spesies yang hidup di ekosistem perairan danau mempunyai karakteristik yang berbeda disetiap kedalaman danau. Berdasarkan hal tersebut danau terbagi menjadi beberapa daerah, diantaranya;
Daerah litoral
Daerah litoral merupakan perairan dangkal yang masih dapat ditembus oleh cahaya matahari. Air di daerah ini cenderung hangat dan berada dipinggir an danau, tanaman yang biasa tumbuh di sini seperti teratai, eceng gondok sedangkan untuk hewan yang biasa hidup di daerah ini ada katak, serangga.
Daerah limtenik
Daerah limtenik merupakan perairan bebas dan masih dapat di jangkau oleh sinar matahari namun jauh dari pinggiran danau. Di daerah ini di huni oleh zooplankton, ganggang dan fitoplankton.
Zooplankton di makan oleh ikan kecil, ikan kecil di makan ikan yang lebih besar, ikan yang lebih bsar dimakan ular atau burung dan seperti inilah 8 terjadinya rantai makanan.
Daerah profrundal
Daerah profundal merupakan perairan yang cukup dalam (afotik). Cahaya matahari yang dibutuhkan mahluk hidup untuk fotosintesis tidak dapat menembus daerah ini. Organisme yang hidup di daerah profundal seperti cacing dan mikroba.
Daerah Bentik
Daerah bentik merupakan dasar danau. Di sini terdapat bentos (Organisme yang hidup di dasar danau), dan sisa-sisa organisme yang telah mati.
Demikian sedikit penjelasan mengenai pembagian zona perairan di danau semoga bermanfaat bagi sahabat cinta sains.